Produktion af biobrændsel medfører særlige filtreringsudfordringer, da kvaliteten af råstoffer kan være stærkt varierende. At omdanne varierende råstoffer til rent biobrændsel af høj kvalitet kræver stor filtreringsekspertise og nøje kendskab til procesteknologien.
 
Typiske filtreringsprocesser ved fremstilling af biodiesel:

- Filtrering af råstoffer, f.eks. koldpresset olie fra frø eller
  animalsk fedt, samt forbehandling af raffineret olie
- Frafiltrering af ler, kul og silica fra raffineret olie.
- Fjernelse af urenheder og steroler fra methylester (biodiesel).
- Filtrering af glycerin til fjernelse af faststoffer eller aktivt kul.
- Slutproduktfiltrering (polering)
 
Standard-filtre til fremstilling af biodiesel:

- Vertikale og horisontale trykbladsfiltre til filtrering af råolie.
- Filtre med returskyl til fin-filtrering
- Pose- og patronfiltre til fin-/sikkerheds- og slutproduktfiltrering.
- Fuldautomatiske filteranlæg